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Las regionales de Atlántico, Córdoba, Magdalena y César fueron sometidas a investigaciones por parte de la Procuraduría General de la Nación, por presuntas irregularidades en contratos que se realizaron antes de la restricción de Ley de garantías, lo que estaría relacionado con participación política.
Luego de pruebas, visitas y testimonios, la Procuraduría inició una investigación disciplinaria a nueve regionales del país, entre esas Cesar, Atlántico y Magdalena por su posible participación en política y contratación de servicios.
Para el caso del Sena en el Cesar, también se abrió investigación a los siguientes funcionarios: Orlando Saavedra (Director regional), Carlos Mero (Subdirector de operación y mantenimiento minero) y Eduardo Oliver (Subdirector del Centro biotecnológico).
La Procuraduría finalmente agregó que todavía se adelantan las pertinentes investigaciones a varias regionales, entre éstas la de Córdoba.